Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB41L3Q9Y2J2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms