Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
HPS5Q9UPZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HPS5Q9UPZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HPS5Q9UPZ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms