Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR3Q9UNL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms