Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX13Q9UN79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX13Q9UN79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms