Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA4Q9UN74 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA4Q9UN74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms