Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO6Q9UM54 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYO6Q9UM54 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO6Q9UM54 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYO6Q9UM54 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms