Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCTPQ9UKL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms