Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
TNIKQ9UKE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
TNIKQ9UKE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
TNIKQ9UKE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
TNIKQ9UKE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TNIKQ9UKE5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms