Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF2Q9UK05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF2Q9UK05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms