Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNG4Q9UBN1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNG4Q9UBN1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNG4Q9UBN1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNG4Q9UBN1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG4Q9UBN1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNG4Q9UBN1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNG4Q9UBN1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms