Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPG2Q9UBF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPG2Q9UBF2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPG2Q9UBF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPG2Q9UBF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms