Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN10Q9UBB4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN10Q9UBB4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN10Q9UBB4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms