Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS18Q9P253 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS18Q9P253 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS18Q9P253 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms