Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ2Q9NZG7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ2Q9NZG7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ2Q9NZG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ2Q9NZG7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ2Q9NZG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ2Q9NZG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINJ2Q9NZG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NINJ2Q9NZG7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms