Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXL2Q9NZ53 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PODXL2Q9NZ53 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PODXL2Q9NZ53 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PODXL2Q9NZ53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PODXL2Q9NZ53 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms