Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSD3Q9NYI0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSD3Q9NYI0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms