Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX43Q9NXZ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX43Q9NXZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX43Q9NXZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms