Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDAP2Q9NXN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDAP2Q9NXN4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDAP2Q9NXN4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms