Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM28Q9NW13 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM28Q9NW13 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RBM28Q9NW13 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM28Q9NW13 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM28Q9NW13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM28Q9NW13 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM28Q9NW13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM28Q9NW13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM28Q9NW13 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms