Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC40A1Q9NP59 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC40A1Q9NP59 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC40A1Q9NP59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms