Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CBX8Q9HC52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX8Q9HC52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX8Q9HC52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms