Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDEL1Q9GZM8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms