Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PCGF6Q9BYE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
PCGF6Q9BYE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PCGF6Q9BYE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms