Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC3Q9BY71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC3Q9BY71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms