Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC106Q9BWC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms