Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF4Q9BQW3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBF4Q9BQW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms