Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3GL3Q99963 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GL3Q99963 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms