Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGPAT1Q99943 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
AGPAT1Q99943 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGPAT1Q99943 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms