Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TWNKQ96RR1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWNKQ96RR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TWNKQ96RR1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWNKQ96RR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.3 ms