Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNGAP1Q96PV0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms