Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf49Q96NF6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms