Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C12orf42Q96LP6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C12orf42Q96LP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf42Q96LP6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms