Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC11Q96J66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC11Q96J66 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC11Q96J66 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC11Q96J66 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms