Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSL1Q96IY1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSL1Q96IY1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSL1Q96IY1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms