Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMIM10Q96HG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM10Q96HG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10Q96HG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms