Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD4Q96DM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD4Q96DM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGBD4Q96DM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms