Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3DQ96BQ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3DQ96BQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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