Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC47.75■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC47.75■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC47.72■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.23
RB1CC1Q8TDY2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.22
RB1CC1Q8TDY2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC47.61■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC47.58■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC47.58■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC47.58■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
RB1CC1Q8TDY2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC47.55■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
RB1CC1Q8TDY2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
RB1CC1Q8TDY2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC47.4■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
RB1CC1Q8TDY2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms