Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN3Q8TDD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms