Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFBP1Q8NEF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFBP1Q8NEF9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms