Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC112Q8NEF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC112Q8NEF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC112Q8NEF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms