Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM35BQ8NCS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM35BQ8NCS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms