Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00301Q8NCQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms