Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC1AQ8NC01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC1AQ8NC01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms