Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPC24Q8NBT2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPC24Q8NBT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms