Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM1BQ8NB78 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM1BQ8NB78 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms