Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC4Q8N9L1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC4Q8N9L1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms