Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms