Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTD1Q8N815 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms