Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf62Q8N4C0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf62Q8N4C0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf62Q8N4C0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms