Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8N3U1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8N3U1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8N3U1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8N3U1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8N3U1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8N3U1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8N3U1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8N3U1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8N3U1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8N3U1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8N3U1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8N3U1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8N3U1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8N3U1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8N3U1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8N3U1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8N3U1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8N3U1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8N3U1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms